上海治疗尖锐湿疣较好的医院有多家，其中复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院等具有较高的声誉。
复旦大学附属华山医院皮肤科是国家临床重点专科，对难治性、复发性尖锐湿疣的治疗有创新和独到之处，尤其对女性尖锐湿疣患者的诊断、治疗和评估具有丰富经验。
上海交通大学医学院附属瑞金医院皮肤科是国家临床重点专科，在诊治复杂、难治、危重性皮肤病方面有着显著的学科优势。
复旦大学附属中山医院皮肤科是国内最早开设皮肤病专科诊疗的医院之一，能对疑难和危重皮肤病进行规范而有效的综合治疗。