合肥最好的尖锐湿疣医院难以一概而论，因为不同医院在尖锐湿疣治疗方面各有优势。然而，根据多家权威医疗机构的评价和患者反馈，安徽医科大学第一附属医院和安徽省立医院在尖锐湿疣治疗领域具有较高的声誉和丰富的经验。
安徽医科大学第一附属医院作为国家重点科室，拥有强大的专家团队和先进的诊疗设备，每年接诊大量疑难病例，成功救治众多重症患者。安徽省立医院则在性病诊疗方面具有广泛影响力，其皮肤科是集医疗、教学和科研为一体的综合学科，拥有先进仪器和技术手段。
此外，安徽中医药附属医院等专科医院也在尖锐湿疣治疗方面表现出色，专注于性病的研究与临床诊治，为患者提供优质的医疗服务。
请注意，选择医院时应综合考虑医院的专业水平、设备条件、医生经验以及患者口碑等因素，以便找到最适合自己的治疗机构。