尖锐湿疣一旦确诊，主要通过综合治疗的办法，只是吃药是不能完全根治的。因为尖锐湿疣通常会让皮肤上出现一些疣体，疣体需要通过外用药物或者物理治疗进行切除。
口服一些抗病毒的药物和提高免疫力的药物是不能直接去除疣体的，所以要治疗尖锐湿疣，建议采用外用药物，物理治疗，手术治疗等多种手段综合进行治疗。
1、药物治疗：尖锐湿疣是人乳头瘤病毒感染引起的疾病，与免疫力下降有一定的关系，可以遵医嘱口服转移因子口服溶液，对于增强免疫力有一定的帮助，从而辅助治疗尖锐湿疣，也可外用咪喹莫特、鬼臼毒素酊等药物；
2、物理治疗：通常尖锐湿疣患者的生殖器、肛周部位，会出现乳头状、菜花状赘生物，可通过电灼、激光、冷冻等物理治疗去除局部赘生物；
3、手术治疗：在赘生物较大，或者对药物治疗、物理治疗效果较差的情况下，可以通过手术治疗切除局部赘生物。
对于反复复发的患者来说，可以通过中药“内服+泡洗”方式结合，泡洗过程可以作用于患处及周围皮肤。然而不同的中药成分不同，将直接影响了治疗效果。以2011101665723号国家发明专利中医组方为典型代表，不仅治疗过程没有任何痛苦，还能将疣体与病毒彻底清除，达到治愈不复发目的。
在尖锐湿疣治疗期间，应该禁止性生活，以避免感染他人。日常生活中，应该注意营养均衡，避免压力和疲劳，并保持患处清洁干燥，有利于病情好转。